我是南理工自动化学院的,学校对专业进行了整合,以前有三个专业,现在自动化院就这两专业。从专业排名上看是自动化强一些,但那些是因为自动化的一些教授比较牛,学科强势,自动化有控制的博士点,电气还没有博士点,电气的博士都是挂在控制博士点招生的,读研和读博可能不一样,不过本科学不到太多,都是些基础的课程,这两个专业的课程就专业课不太一样,那些牛逼的教授都很忙,一般接触不到的。如果不读研,从工作考虑,虽然这两个专业都不愁找工作,我觉得是电气比较好,电气属于强电,以后工作能进供电或者输电都很好的。自动化就属于弱电,顶多是单片机,PLC和嵌入式开发,更多的是偏向理论,控制到最后就是数学,现在好多控制博士都是从理学院招的。
看你喜欢什么了,喜欢做理论或者以后进一步深造,那就选自动化;只是读个本科,找份工作,两个专业差不多,自动化专业是万金油,哪都能去,但我更看好电气。这个你自己做选择吧。